告别繁琐作图!科晶生物AI Agent在线工具,一键精细绘制“蛋白-小分子”结合位点图
在生物医学研究、靶点发现及创新药研发的过程中,分子间相互作用(如蛋白-小分子化合物结合位点)的可视化分析是日常科研与SCI论文撰写中不可或缺的关键“门面”。然而,面对传统三维可视化软件陡峭的学习曲线、繁杂的参数调整,许多科研人员往往为了调整一个视角、隐藏一个残基而耗费大量宝贵的时间。
为普惠广大生物医药领域的科研工作者及从业者,方便大家更高效地推进科研创新,把精力留给纯粹的科学思考,科晶生物研发团队重磅推出了一款强大的自动化AI Agent(智能体)在线分析工具——“图”!

这款专为分子间相互作用可视化设计的在线神器,真正做到了“智能洞察,一键出图”。无需下载安装庞大的本地客户端,打开浏览器即可体验前所未有的精细化制图效率!
官方在线体验网址: www.kjbiorpa.com
智能洞察:双模互作分析,一站式解决
该在线工具全面兼容日常科研中最核心的两大分析类型,无论是靶向药物研发还是结构生物学研究,都能完美匹配:
- “蛋白-配体互作”分析
- “核酸-配体互作”分析
实操展示:4步沉浸式体验“发刊级”极速出图
为了让大家快速上手这款高效便捷的工具,我们以最常用的**“蛋白-配体互作”**为例,为您全景拆解这款神器的“保姆级”操作流程:

Step 1: 极简数据输入 & 智能参数配置
选定具体的互作类型后,系统提供了高度灵活的数据输入方式:您可以直接输入**“PDB ID”进行云端智能抓取,也可以选择本地“上传PDB文件”**。

- 高阶定制:数据导入后,点击“隐藏高级选项”,您可以根据具体的分析需求,精准勾选对应的参数项目,或在输入框中适当调整参数(如结合位点距离 Binding Site、芳香环共面性 Aromatic Planarity等)。设置好后直接点击**“分析”**,让云端AI为您代劳后续的复杂运算!

Step 2: 报告可视化,核心作用力一目了然
短短几秒后,您即可在**“报告可视化”**界面看到详尽的数据分析结果。
- 自动识别互作力:下滑结果内容,系统会自动分析并默认勾选常规的关键分子间作用力,如氢键(Hbond)、**亲疏水作用(hydrophobic)**等。
- 实时图示设置:在界面右侧的“分子结构可视化”结果中,用户还可以根据发文的排版需求,对最终展示的分析结果进行个性化的图示设置。


Step 3: 3D全屏沉浸交互,细节由你掌控
对应的分析结果及图示类型设置结束后,点击**“render”**,一张精美的高精度3D分子视图即可呈现!
- 全局与细节并重:点击视图中的全屏展示,您能更直观地看到配体与蛋白结合的氨基酸残基位置及氢键网络。点击**“render residue”**即可一键清晰显示配体与蛋白结合的残基信息。
- State Tree(状态树)精细管理:画面太满抓不住重点?点击界面左边栏的“state tree”,您可以像操作设计软件的图层一样,在更多的展示细节中对相应的部分进行“隐藏/展示”操作,完全根据您的论文需求进行个性化取舍。

Step 4: 灵活的绘图输出与可溯源编辑(高阶玩法)
好用的工具不仅在于“算得准”,更在于“出图美”与“可追溯”!科晶生物为您提供了满足各类排版需求的输出方案:
- 一键透明高清直出:找到完美视角后,点击 "Screenshot/State Snapshot" 即可将可视化结果导出。如果排版需要无背景的分子图,只需将 "Transparent" 设置为 "on" 即可一键去背!(注:此处下载的为纯图片文件,无法在工具中进一步3D修改)
- 独家“状态保存”功能:科研作图最怕无法修改重头再来。如需日后再次编辑,只需点击 “download state” 下载状态结果包。解压后您将得到三种文件(包含
model.molj、.mvsj及report.xml)。下次只需将后缀为.mvsj的文件在对应位置打开,或将.molj文件在“state”中打开,即可100%还原您的3D工作现场! - 内置“绘图输出”排版工坊:点击 “export pics” 可将可视化结果直接无缝加载到“绘图输出”模块中。当图片包含多个视图时,左边栏可以轻松调整视图的隐藏及层级关系;右边栏则提供了丰富的提示,助您对图片进行终极的个性化排版与编辑,轻松拼合出版级组图!

结语:科技赋能,普惠实践促研发
秉承着**“智能洞察,普惠实践促研发”**的理念,科晶生物始终致力于打破科研工具的技术壁垒。这款“图”自动化AI Agent在线分析工具,将繁琐枯燥的分子可视化渲染工作化繁为简。
无论您是药化专家、结构生物学家,还是正在攻克大论文的硕博研究生,它都将是您不可多得的科研提效利器。
别再让繁杂的制图软件拖慢你的发文速度了!把排版交给AI,把时间留给科研!
AtomGit 是由开放原子开源基金会联合 CSDN 等生态伙伴共同推出的新一代开源与人工智能协作平台。平台坚持“开放、中立、公益”的理念,把代码托管、模型共享、数据集托管、智能体开发体验和算力服务整合在一起,为开发者提供从开发、训练到部署的一站式体验。
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