在数字化生物时代，如何从海量化合物中快速锁定与目标蛋白强互作的候选分子，已成为生命科学研究的核心挑战之一。传统实验筛选方法周期长、成本高、成功率低，而基于计算生物学的虚拟筛选技术，正以其高效、精准、低成本的优势，成为现代生物研发不可或缺的核心工具。

科晶生物深耕数字生物领域，依托前沿的 AI 结构预测技术与成熟的分子对接算法，打造了标准化、高精度的小分子化合物虚拟筛选服务体系，为全球科研工作者提供从化合物库预处理到最终结果解析的一站式解决方案。

三轮递进式筛选，层层锁定高亲和力分子

科晶生物采用行业领先的 Autodock Vina 分子对接平台，创新性地设计了 "高通量初筛 - 虚拟复筛 - 精细化终筛" 的三轮递进式筛选流程，在保证筛选效率的同时，大幅提升了结果的可靠性。

• 第一轮：高通量初筛：快速处理大规模化合物库，初步筛选出潜在的活性分子，提取亲和力排名前 5% 的化合物进入下一轮
• 第二轮：虚拟复筛：提高对接精度参数，进一步缩小候选范围，再次提取前 5% 的优质分子
• 第三轮：精细化终筛：采用最高精度的对接设置，获得最可靠的结合亲和力数据，最终确定高潜力候选化合物

全流程技术保障，确保结果精准可靠

1. 专业的化合物预处理

科晶生物对所有化合物进行标准化预处理，包括 2D 转 3D 结构转换、加氢处理、Gasteiger 电荷计算、能量最小化以及 MMFF94 力场优化，并使用 OpenBabel 工具统一转换为 pdbqt 格式。同时，系统会自动去除重复化合物和无法建模的无效分子，确保筛选数据的质量。

2. AI 赋能的蛋白结构构建

采用最新的 AlphaFold3 技术对目标蛋白进行高精度三维结构预测，为分子对接提供可靠的受体模型，解决了许多缺乏实验晶体结构的蛋白研究难题。

3. 高精度的对接参数设置

• 采用 0.375Å 的高分辨率网格间隔
• 设置 Exhaustiveness=128 的高搜索精度
• 精确界定对接搜索空间的中心和尺寸
• 每个化合物生成 3 个最优对接构象并按亲和力排序

标准化结果输出，提供完整的数据分析支持

科晶生物的虚拟筛选服务提供全面、详细的结果文件，包括：

• 完整的数据分析总表，包含所有化合物的结合亲和力评分
• 每个候选化合物的对接构象文件（output）
• 详细的计算参数和过程日志文件（log）

同时，我们提供专业的结果解读服务，明确标注不同亲和力水平的化合物：

• 非常好的结合：≤-10 kcal/mol
• 良好的结合：-7 ~ -10 kcal/mol
• 中等结合：-5 ~ -7 kcal/mol
• 弱结合：> -5 kcal/mol

为什么选择科晶生物？

1. 技术领先：融合 AlphaFold3 结构预测与 Autodock Vina 分子对接技术，紧跟国际前沿
2. 流程标准：建立了完善的标准化操作流程，确保服务质量稳定可靠
3. 结果精准：三轮递进式筛选策略，兼顾效率与精度
4. 交付全面：提供完整的原始数据和专业的结果解读
5. 服务高效：专业的技术团队，快速响应客户需求，缩短研发周期

科晶生物始终致力于用先进的计算生物学技术赋能生命科学研究。无论您是从事基础研究还是应用开发，我们都能为您提供定制化的化合物虚拟筛选解决方案，帮助您加速研究进程，降低实验成本，提高研发成功率。