易基因|项目文章:DNA甲基化及多组学测序揭示神经退行性疾病的表观遗传调控发病机制
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帕金森病(Parkinson’s disease,PD)是一种常见的神经退行性疾病,以进行性多巴胺能神经元退行性病变和运动功能障碍为主要特征。少突胶质细胞功能障碍通过髓鞘形成受损参与PD发病机制。2025年,河北医科大学基础医学院王磊教授团队发表了题为“Oligodendrocyte-Specific STAT5B Overexpression Ameliorates Myelin Impairment in Experimental Models of Parkinson’s Disease”的研究论文,揭示了帕金森病中少突胶质细胞髓鞘损伤的表观遗传新机制。易基因科技为本研究提供DNA甲基化测序技术服务,助力揭示DNMT3A-STAT5B-MBP表观遗传调控轴在PD相关髓鞘损伤中的关键作用。

研究首先通过单核RNA测序(snRNA-seq)发现,在MPTP诱导的PD小鼠模型中,少突胶质细胞比例显著下降、分化成熟障碍,关键转录因子STAT5B表达显著下调。进一步构建少突胶质细胞特异性AAV-MAG-OE-STAT5B过表达系统,证实STAT5B可通过直接结合MBP启动子激活其转录,从而改善髓鞘完整性、保护多巴胺能神经元并恢复运动功能。下游靶基因DNA甲基化测序验证(TBS)鉴定出STAT5B启动子区域CpG岛2202位点的DNMT3A介导高甲基化是PD中STAT5B表达沉默的表观遗传机制。本研究结果表明DNMT3A-STAT5B-MBP轴介导PD相关髓鞘损伤,进而将表观遗传失调与少突胶质细胞功能障碍及随后PD发病机制联系起来,为PD精准干预提供全新的靶点与生物标志物。

图形摘要
易小结
本研究阐明了“胶质细胞表观遗传失调-髓鞘损伤-多巴胺能环路衰竭”的级联病理新机制,并揭示启动子甲基化作为疾病标志物的可行性,介导从基础机制研究向临床应用转化。
易基因提供的靶基因DNA甲基化测序(TBS)技术,以其靶向区域高深度覆盖、单碱基分辨率及多重CpG位点检测优势,精准定位STAT5B启动子差异甲基化位点,为解析DNA甲基化在神经退行性疾病中的作用提供金标准证据。
研究方法
(1)动物模型和细胞处理:建立8周龄雄性C57BL/6小鼠的亚急性PD模型;培养人少突胶质细胞系MO3.13和神经母细胞瘤细胞系SH-SY5Y,并诱导其分化。
(2)snRNA-seq:对小鼠黑质(SN)进行snRNA-seq分析,包括聚类、细胞类型注释及差异表达基因分析、富集分析。
(3)伪时间轨迹分析与转录因子活性预测:对少突胶质细胞亚群进行伪时间轨迹分析,重构其分化路径。预测并比较PD组和对照组少突胶质细胞中转录因子(TF)的活性变化。
(4)组织学与免疫染色
免疫荧光(IF):检测STAT5B与Olig2(少突胶质细胞标志物)及MBP(髓鞘碱性蛋白)的共表达与表达水平。
免疫组化(IHC):检测酪氨酸羟化酶(TH,多巴胺神经元标志物)和神经丝轻链蛋白(NfL)表达。
LFB染色:对髓鞘进行组织化学染色,定量评估髓鞘密度和完整性。
透射电子显微镜(TEM):定量评估髓鞘损伤程度。
(5)分子生物学实验
RT-qPCR与Western blot:检测STAT5B、MBP、TH、DNMT3A等基因的mRNA和蛋白表达水平。
双荧光素酶报告基因实验:验证STAT5B与MBP启动子区的结合及转录激活能力。
放线菌素D(ActD)实验:检测MPP+处理后STAT5B mRNA的稳定性。
(6)行为学实验:转棒实验、爬杆实验和步态分析评估小鼠的运动功能。
(7)DNA甲基化分析
靶向甲基化测序(TBS):对STAT5B启动子区域CpG岛进行靶向测序,精准检测CpG位点甲基化水平。

关键结果
(1)snRNA-seq揭示MPTP诱导PD小鼠模型中少突胶质细胞驱动的髓鞘成熟缺陷
研究首先通过snRNA-seq分析了MPTP模型及对照组小鼠黑质中的细胞图谱。结果显示,PD组中少突胶质细胞的比例显著降低(图1A)。差异基因表达分析发现,PD组少突胶质细胞中髓鞘相关关键基因(Sox10、Plp1、Mbp、Mog、Mag、Mobp)表达显著下调(图1B-C)。通路富集分析表明,PD少突胶质细胞的髓鞘形成、轴突包绕等功能受损,而帕金森病进展、轴突损伤等通路异常激活(图1D)。

图1:少突胶质细胞单核转录组谱特征分析。
(2)少突胶质细胞中的STAT5B是MPTP诱导PD小鼠模型髓鞘损伤的关键调控因子
为鉴定调控少突胶质细胞功能障碍的关键转录因子,研究者利用DoRothEA软件分析发现STAT5B是PD少突胶质细胞中下调最显著的转录因子(图2A-C)。Pearson相关性分析显示,髓鞘密度与STAT5B的mRNA和蛋白表达水平呈显著正相关(图2D-E)。

图2:发现并验证STAT5B为关键调控因子。
(3)DNMT3A通过DNA甲基化降低STAT5B表达
研究人员最后研究了STAT5B上游的表达调控机制。首先,放线菌素D实验表明,MPP+处理并未介导STAT5B mRNA稳定性变化(图3A),提示其下调主要源于转录水平的抑制。研究人员注意到STAT5B启动子区域存在密集的CpG岛(图3B),暗示DNA甲基化的潜在调控作用。随后,研究通过靶向甲基化测序(TBS)对STAT5B启动子区域进行单碱基分辨率甲基化水平检测。结果显示与对照组相比,PD模型(MPP+处理)中STAT5B启动子的多个CpG位点甲基化水平显著升高,其中以第2202位点变化最为显著(图3C-D)。这一发现精确定位可能影响STAT5B表达的关键甲基化区域,为后续机制研究提供精确坐标。
此外为验证DNMT3A作为甲基化转移酶的作用,研究进行了系统的功能实验和验证。结果完整构建了“MPP+诱导→DNMT3A上调→DNMT3A介导STAT5B启动子CpG 2202位点高甲基化→STAT5B转录沉默→MBP下调→髓鞘损伤”的表观遗传调控通路。

图3:STAT5B mRNA稳定性与启动子甲基化研究
结论和启示
本研究发现并证实在帕金森病模型中,DNA甲基转移酶DNMT3A介导的STAT5B启动子高甲基化是导致少突胶质细胞功能障碍和髓鞘损伤的核心表观遗传调控机制。该高甲基化通过抑制STAT5B转录,进而抑制其对髓鞘碱性蛋白MBP的转录激活,最终导致髓鞘损伤、多巴胺能神经元退变和运动功能障碍。在少突胶质细胞中特异性过表达STAT5B可以挽救这些病理改变,证明靶向此轴的治疗潜力。
研究展示了靶向深度甲基化测序(TBS)在精准定位差异甲基化位点、解析表观遗传因果机制中的独特优势,尤其适用于大样本临床队列的表观遗传标志物筛选和药物靶点验证。
参考文献:
Li Y, Su Z, Zhai J, Liu Q, Wang H, Hao J, Tian X, Gao J, Geng D, Wang L. Oligodendrocyte-Specific STAT5B Overexpression Ameliorates Myelin Impairment in Experimental Models of Parkinson's Disease. Cells. 2025 Jul 25;14(15) doi: 10.3390/cells14151145.
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