081B 基于R包-Ecospat的生态位重叠分化迁移分析与可视化制图(单物种和多物种版本)【2027】
基于R包-Ecospat的生态位重叠-分化-变迁分析与可视化制图(单物种和多物种版本)【2027】
本教程旨在通过系统的培训学习,学员可以掌握数据的获取处理、可视化制图、基础写作等。课程内容培训针对0基础学员,所有内容均为中文实操演示,可以查看每一步操作;每章节内容无固定时长,知识点讲完为止。
课程特点介绍:
该套课程特点:(1)该“Ecospat”课程支持与maxent、Biomod2、GARP等模型数据的关联分析,增加论文数据,降低论文重复率;(2)提供约3500字定制写作Word模板,降低分析与写作难度;(3)Ecospat新增单物种多时期多情景数据分析,与多物种之间分析的内容;(4)包含Schoener_D、Hellinger_I、Centroid_Shift、Centroid_Shift_Axis1、Centroid_Shift_Axis2、Equivalency_Pvalue Similarity_Pvalue等结果指标;(5)支持自定义绘图(参数可调),生态位重叠图自定义参数(是否显示-背景点、背景点质心、样本点、颜色、线条、字号等),个人图表差异性展示,所有图自动导出PDF+tif矢量图,支持投稿和二次编辑排版;(6)详细的结果解读和写作思路参考资料指导。
课程主要内容:
1.视频附带资料下载和密码
专题一相关软件安装和参数配置
1.R、Rtools软件和工具包安装
2.环境变量配置与测试
3.R包安装和报错说明
专题二 单一物种不同时期气候情景下的生态位重叠、分化、变迁方向距离分析与可视化
- PCA分析与可视化制图
- 等价性检验与相似性检验直方图
- 生态位重叠分化变迁动态图
- 相关指标计算与解读(Schoener_D、Hellinger_I、Centroid_Shift、Centroid_Shift_Axis1、Centroid_Shift_Axis2、Equivalency_Pvalue Similarity_Pvalue)
该专题通过PCA分析揭示驱动物种生态位分化的主要环境梯度,分析单一物种在不同时期和气候情景下的生态位重叠指数、生态位分化指数、生态位变迁方向与距离指数分析与可视化制图。生态位变迁≠适宜区质心迁移,课程解释概念区别。
部分结果草图展示:







|
Period |
SSP |
Schoener_D |
Hellinger_I |
Centroid_Shift |
Centroid_Shift_Axis1 |
Centroid_Shift_Axis2 |
Equivalency_Pvalue |
Similarity_Pvalue |
|
2021-2040 |
ssp126 |
0.758 |
0.8163 |
0.6868 |
-0.6811 |
-0.0879 |
0.0099 |
0.0594 |
|
2021-2040 |
ssp245 |
0.7317 |
0.7831 |
0.7569 |
-0.7517 |
-0.0886 |
0.0099 |
0.0495 |
|
2041-2060 |
ssp126 |
0.7572 |
0.8065 |
0.7154 |
-0.6976 |
-0.1583 |
0.0099 |
0.0396 |
|
2041-2060 |
ssp245 |
0.6805 |
0.7387 |
0.9928 |
-0.9872 |
-0.1048 |
0.0099 |
0.0297 |
|
2061-2080 |
ssp126 |
0.6941 |
0.7655 |
0.9268 |
-0.9205 |
-0.1083 |
0.0099 |
0.0495 |
|
2061-2080 |
ssp245 |
0.6706 |
0.7181 |
0.9926 |
-0.9727 |
-0.1975 |
0.0099 |
0.0297 |
|
2081-2100 |
ssp126 |
0.6677 |
0.7428 |
1.0368 |
-1.0311 |
-0.108 |
0.0099 |
0.0297 |
|
2081-2100 |
ssp245 |
0.6781 |
0.7194 |
1.1264 |
-1.1039 |
-0.2241 |
0.0099 |
0.0396 |
专
专题三 多物种生态位重叠、分化、变迁分析与可视化制图
- 等价性检验与相似性检验直方图
- 生态位重叠分化变迁动态图
- 相关指标计算与解读
该专题主要用于多物种的生态位重叠、生态位分化。生态位变迁计算与结果可视化分析,例如A物种和B物种的生态位相似度分析与绘图。



专题四 写作思路指导(带写作参考Word文字版)
该专题提供写作参考Word文档约3500字(6页),包含该部分的实验方法,结果展示与分析,结论和讨论部分。
AtomGit 是由开放原子开源基金会联合 CSDN 等生态伙伴共同推出的新一代开源与人工智能协作平台。平台坚持“开放、中立、公益”的理念,把代码托管、模型共享、数据集托管、智能体开发体验和算力服务整合在一起,为开发者提供从开发、训练到部署的一站式体验。
更多推荐


所有评论(0)