Zonae Cogito + R工具Marxan保护区规划决策实战会议教程【2027】

本教程旨在通过系统的学习，使学员掌握Zonae Cogito决策支持系统与Marxan保护规划软件的完整使用方法，结合R语言可视化工具实现从数据准备、参数自动化校准与结果可视化、模型运行到成果制图的全流程操作。课程为中文实操演示针对0基础学员。

课程特点：

（1）全网首套中文Zonae Cogito+R下的Marxan系统教程；（2）课程涉及100+个核心参数全解析；（3）SPF和BLM支持线性梯度与指数梯度自动调参，自适应FPF智能寻优，结合R绘制调参高质量图；（4）基于聚类分析解空间，基于Bray-Curtis相异指数和NMDS降维的100个方案聚类，提供空间多样化备选方案集；（5）发文利器查重低，Zonae Cogito+R workflow在国内文献中罕见，方法描述与可视化原创性强；（6）运行过程和结果可视化，支持所有结果快速预览，可视化调节参数；（7）成本阈值控制，灵活设置预算上限与分段惩罚机制；（8）所有结果可导出，支持CSV数据、Shapefile矢量、BMP制图及R数据二次分析；（9）课程涉及多个软件组合使用（R+Rstudio+ARCGIS+Zonae Cogito+Marxan等）。（10）支持基于maxent、Biomod2、GARP等众多模型结果的保护区规划-作为生态位模型结果数据的拓展分析内容；（11）支持多物种和单物种保护区规划；（12）支持与现有保护区数据关联分析，也可以设定特殊区域划入/排除在保护区结果中。

具体内容（部分草图展示）：

专题一：软件安装和环境配置

1.Zonae Cogito、Marxan（v 2.43）、R+Rstudio+ARCGIS软件安装参数配置

专题二：单物种-保护区数据文件制作

1.成本数据制作

pu.datpuvsp.datspec.datbound.dat文件制作和说明

专题三：多物种-保护区数据文件制作

pu.datpuvsp.datspec.datbound.dat文件制作和说明

专题四：Zonae Cogito和Marxan关联运行

1.数据加载和可视化调参-模型参数介绍（支持BLM和SPF等可视化批量调参）

2. Zonae Cogito参数功能介绍

3. 可视化调整数据参数（设置模型基础参数）

该部分涉及到约40个模型的基础参数介绍和设置说明，可以根据课程介绍说明完成参数的调整。

4.BLM自动调参和结果可视化

该部分可以实现BLM自动化调参与调参结果可视化绘图（基于R获取高清矢量图），并获取最优BLM参数。

调参结果原始数据自动化导出结果如下参考图：

5.SPF自动调参和结果可视化

该部分可以实现SPF自动化调参与调参结果可视化绘图（基于R获取高清矢量图），并获取最优SPF参数。

5.Zonae Cogito系统自带SPF、BLM调参绘图演示

6. FPF自适应调参功能介绍

7.基于最优参数可视化运行marxan

该过程支持快速预览最优保护区结果图、保护区PU选择频率图、每一次的运行结果图等。

专题五：marxan结果聚类分析

1.聚类分析和可视化绘图

通过聚类分析，可从Marxan大量（100个）保护方案中识别出空间结构差异显著的方案类型，查看不同代表性方案差异大小，以及方案分散集中程度，为决策者提供可管理的、空间多样化的备选方案集。

聚类分析参考图（含3D空间动态图）：

2.聚类分析结果解读

3.聚类分析写作思路指导

专题六：marxan保护区结果可视化编辑

1.支持可视化手动编辑保护区范围

2.保护区结果导出与二次可视化制图

3.保护区结果与项目文件叠加（例如地图、已有保护区、城市工厂等）

高阶内容：

基于空间位置的规划单元状态分级与批量赋值

1.现有自然保护区数据快速导入与状态锁定

本模块教授学员运用ArcGIS 空间分析工具，将外部已有的自然保护区边界数据与 Marxan 规划单元图层进行智能关联。针对核心保护区（已有保护区等），自动锁定划入marxan保护区结果；针对特殊限制区域（如工厂居民区等），强制排除在marxan保护区之外；针对一般待规划区域，开放给算法基于成本与保护目标自主抉择，实现刚性约束与弹性优化的科学配置。

2.数据文件制作和后期调参建模可视化制图