Linux下安装R依赖包。

进入R ：

运行
library(‘Seurat’)

1.在线安装
install.packages(“包名”)
如：install.packages(“Seurat”)
2.指定目录安装
install.packages(“Seurat”, lib=’/usr/lib64/R/library’)
3.批量安装
install.packages(c(“miniUI”, “shiny”, “sctransform”, “plotly”, “leiden”,“reshape2”,“RcppEigen”,“spatstat”,“reticulate”))

4.linux下R语言离线安装依赖包
R CMD INSTALL xx.package.tar.gz

R-安装、卸载、查看及卸除加载包

1. 安装包
   install.packages(“BiocInstaller”)

指定版本安装：BiocManager::install(pkgs=“spatstat”,version=‘1.64-1’)

2. 卸载已安装包
   remove.packages(“BiocInstaller”)

3. 查看已加载包
   (.packages())

4. 卸除已加载包
   detach(“package:BiocInstaller”)

5. 查看已安装的包
   installed.packages()

6. 查看某个安装包提供的函数
   help(package=“BiocInstaller”)

7. 查看某个函数属于哪个包
   help(“biocLite”)

8.查看package的version
packageVersion(“Seurat”)

9.查看包的安装位置
find.package(“Seurat”)

查看R版本
sudo -i R

查看下路径，是否是刚才自己安装的R。敲R，或全路径进入R
which R

退出：
quit()