在百度上查了好多，试了下都没有用，可能情况不同。我的mysql版本是mysql5.6.40

我的方法是

重新配置my.cnf

vi /etc/my.cnf 

#在[mysqld]中添加：

datadir = /usr/local/mysql/data

log-error = /usr/local/mysql/data/error.log

pid-file = /usr/local/mysql/data/mysql.pid

user = mysql

tmpdir = /tmp

#保存退出

然后再初始化数据库：

在mysql目录下的scripts目录中：

./mysql_install_db --user=mysql --basedir=/usr/local/mysql --datadir=/usr/local/mysql/data --pid-file=/usr/local/mysql/data/mysql.pid --tmpdir=/tmp

我的效果：

[root@mini1 scripts]# ./mysql_install_db --user=mysql --basedir=/usr/local/mysql --datadir=/usr/local/mysql/data --pid-file=/usr/local/mysql/data/mysql.pid --tmpdir=/tmp

然后重启mysql

service mysqld restart 

成功

转载自http://blog.51cto.com/rabbit2013/1341055