Pymol教程–surface/cartoon透明度的调节(静电势能)

视频教程来自于钰沐菡， https://www.bilibili.com/video/BV1bZ4y1G765?spm_id_from=333.999.0.0

  • Step1, 下载蛋白:fetch 4pl6

  • Setp2, 隐藏Non-bonded interactions - 非键接相互作用

  • Setp3，生成静电势能

  • Setp4， 设置透明度，setting->edit all

  • Setp5,选择原来蛋白

  • Setp6， 改颜色，

    效果如下：

  • Setp7， 单独给cartoon设置颜色：set cartoon_color, yellow

  • Setp8, 恢复默认颜色， set cartoon_color, default

  • Setp9, 给特定对象设置颜色set cartoon_color, yellow, 4pl6

  • Setp10， 给特定对象设置透明度， set cartoon_transparency 0.4 4pl6

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