PyMol安装教程(Windows10)

pymol的使用需要基于python环境，本教程从python环境配置开始，基于python2.7进行安装。如果您曾经安装过python，可以直接进入pymol安装步骤，但是要留意下载对应版本的whl文件。

本次使用到的文件：链接：https://pan.baidu.com/s/1aPQggII3HvvTM6X3j-wlhA  提取码：1234 

Python环境配置

1.下载与安装

首先进入python官网的Windows版本下载页面 点这里

点击红框里的链接下载2.7版本的python。

 

 

 

红框里的两个文件需要根据系统版本选择。查看操作系统版本的方法：双击进入“我的电脑”，空白处右键“属性”，找到系统类型，如果为“64位系统，则选择下图中的“Windows x86-64 MSI Installer” ；否则选择另一个进行下载。

将下载得到的文件双击运行，开始安装。第一个界面选择Install for all users。

然后是选择安装路径(红框里的东西)的环节，默认一般为C:\Python27\，如果想装在别的位置要注意路径不能包含中文名的文件夹(像 D:\学习\Python 这样的路径是不可以的)。

之后一路next就好了。点Finish结束，就快要装好了。

2.配置环境变量

首先找到安装python的文件夹，即上文的安装路径，复制红框里的内容。

之后还是进入“我的电脑”，空白处右键选择“属性”。选择红框里的“高级系统设置”。

按照箭头的指示，先点击“系统属性”中的“环境变量”；然后在“环境变量”中找到“Path”，点击下面的编辑；点击新建，粘贴刚刚复制的路径。之后一路确定只可。

这里安装和配置就完成了。可以通过以下的方法来验证是否安装成功：同时按住小窗户键+R键，在弹出的窗口中输入cmd并回车，在弹出的黑框界面输入：

python -V

如果出现了python版本即按照正确，可以关掉了；也可以再输入“python”查看python版本信息。

安装PyMol

1.下载whl文件

点这里下载

在页面中找到如下三个文件进行下载。numpy版本无需关注，27代表python2.7，amd64代表64位cpu，如果不确定选择含有win32字样的版本即可。

三个文件分别位于以下两个个分栏：NumPy，Pymol-open-source。

 

将下载好的三个文件放在一个英文路径的文件夹中，例如C:\pymol，然后进入cmd界面(小窗户+R，输入cmd回车)，分别输入以下三条命令(复制，并在命令行界面点击右键)：

C:\Python27\python.exe -m pip install C:/pymol/numpy-1.16.6+mkl-cp27-cp27m-win_amd64.whl
C:\Python27\python.exe -m pip install C:/pymol/pymol-2.1.0-cp27-cp27m-win_amd64.whl
C:\Python27\python.exe -m pip install C:/pymol/pymol_launcher-2.1-cp27-cp27m-win_amd64.whl

如果出现successflly installed字样则说明安装成功。

关于三条命令，红框部分是python.exe的位置，如果您之前修改了python的安装路径，找到它的位置，并检查是否有意python.exe，然后分别修改三条命令中的红框内容为你的路径；绿色框是我们存放whl文件的位置，蓝色框为文件名称，这些都可以按您实际的安装位置进行修改。

至此pymol安装完成。