PyMOL作图：设置标签（Label）

PyMOL标签（Label）的默认字体、大小和位置等参数通常需要进行调整以满足出版图片的高质量要求。因此，我们需要深入了解标签的详细信息，以设置适当的标签参数。在PyMOL中，使用Label和set命令可以轻松修改标签的各种属性，包括标签大小（label size）、标签颜色（label color）、标签位置（label positioning）、标签字体（label font）等等。在下面的示例中，我们将以1a0q结构的可视化展示为例，逐一尝试不同的标签设置。

1. 标签大小（label size）

默认的标签大小为14可能不够清晰，可以尝试调整标签大小以适应图片的要求。以下我们的目标是给1a0q结构中的锌离子加上“Zn”的标签，具体在PyMOL的命令行中操作如下：

#下载1a0q
fetch 1a0q
#修改背景色为白色
bg_color white
#移除所有水分子
remove resn HOH
#给锌离子加上标签标注
label resn ZN, "Zn"
#设置标签大小，增加至30
set label_size, 30

最终效果如下⬇:

由于默认字体大小为14，所以尽管加了标签也看不出来（如上图左）。因此我们增加标签至30，但其效果显示的不尽人意（如上图右），还需要将标签的位置进行调整。

2. 标签位置（label positioning）

标签可能需要根据需要移动到更合适的位置，设置标签相对于原始 X、Y、Z 坐标的任何偏移。使用鼠标在Mouse下选择进入3 Botton editing模式，并按ctrl用鼠标左键点击来拖动标签至合适的位置；ctrl-shift-left_click 可以在 z 方向移动标签。 最终我们可以将锌离子的标签移至合适的位置，效果如下图所示。

3. 自定义标签颜色（label color）

默认颜色可能与背景不够对比，我们可以自定义标签文本的颜色。可以为不同的对象选择使用不同颜色的标签。例如将锌离子的标签颜色从默认的黑色修改为红色。

set label_color, red, resn ZN

最终效果如下图所示：

4. 标签字体（label font）

如果你需要调整发表文章中所有图片标注的字体，将他们统一设置为一种字体，那么label_font_id是一个必须了解的元件。

4.1 PyMOL中label的字体与对应的id

下表中是PyMOL所支持设置渲染标签的字体。可以根据自己的需要对照下表选择字体后确认字体的的id。

特殊字符串

4.2 测试字体修改

在PyMOL中的使用方法如下：

set label_font_id, 9

通过以上调整，我们可以更好地控制和定制标签以满足出版图片的质量要求。这些设置可以根据具体需求进一步微调，以确保生成的图像完美呈现所需的信息。