Gephi教程——基本操作

1 整体预览

1.1 概览、数据资料与预览

在Gephi的整个主界面，可以看到三个大的按钮，分别为概览，数据资料和预览。如下图所示：

其中单击概览之后，会切换到图形的可视化的编辑页面。

单击数据资料，可以切换到对于构建当前图的原始数据的页面，在可视化的过程中，很多情况下需要对于原始构建该图的数据进行操作。比如，删除，替换等操作。原始数据在数据资料中是以表格的方式进行呈现，用户可以直接对表格中的数据进行操作。为了便于展示，我随机生成了一个随机图，如下图所示：

对于上图，我们可以查看构成该图的原始数据如下：

在上图中，我展示的是关于节点的原始数据，主要包括节点的ID和Label两个属性列。数据区同时包括边的信息，如下图所示：

在边的原始数据中，主要包括头尾节点(源和目标)的ID，边的类型，边的ID，权重信息等等。最后，无论是节点的表格信息和边的表格信息，我们都可以直接在表格上进行数据操作。

最后是预览按钮，这个部分的主要作用是在图形处理结束之后，当要将图进行输出的时候，可以在这个部分对输出进行调整。

1.2 基本的编辑和设置

通过上面的介绍，相信各位读者对于Gephi的整体上有了一个认识，上面我们提到过，我们在概览中对图进行编辑。现在我们来重点关注与对图形的编辑和设置。

对于图的一般编辑操作，一般都是集中在下面的区域中进行：

为了便于效果展示，上面我生成了一个随机图，在整个的编辑窗口中，提供了编辑节点、边的环境，可以在这里区域内创建新的节点，新的边、对节点的位置进行移动、对节点的颜色和大小进行设置、编辑标签的颜色和大小等等操作。需要注意的是，这里的操作都是针对单个的节点进行操作，不能进行自动处理和批处理。

在上面的窗口中，我们可以看到，整个操作的选项分布在左侧和下侧。这两个工具箱的位置是固定，不能够改变它们的位置。左侧工具箱中的选项主要是针对节点和边的相关信息进行创建和修改等等操作。而下侧的工具箱主要是针对整个窗口图像的相关设置。例如图中的节点显示，标签的大小调整等等。

1.3 左侧工具箱

具体的，左侧工具箱中的选项的作用如下：

这里有几个需要注意的点：

1. 单选是选择图中的一个节点，而矩形选取是通过矩形来囊括一个区域内部的所有的节点。
2. 关联节点涂色对应的也是单个节点的处理。
3. 如果在选择使用矩形选取的前提下，没有执行划定区域，则单个节点涂色，节点大小调整，关联节点涂色等功能表无法实现。

下面，我们介绍各个功能的使用：
4. 全屏的作用是将整个界面进行全屏展示。如果单独想要放到当前的窗口，可以使用鼠标右键点击窗口，选择“浮动选项”来进行处理，同时对于浮动的窗口可以鼠标右键来选择“停靠”，使得窗口可以停靠在当前界面内部。
5. 在当前的窗口中，鼠标移动到某一个节点的时候，那么该节点和其邻接节点就会被显示出来，这样可以进行连接当前的节点的关联情况。进一步，当我们选择扩大鼠标选取范围尺寸调整，这样可以使得显示是当前扩大区域的邻接节点。
6. 单选工具可以单独选择一个节点进行一些操作。单击“单选”按钮，将鼠标移动到某一个节点之上，鼠标右键可以弹出快捷菜单。如下图所示

这里面“删除”是删除当前节点，“移至”、“复制到”是将节点移动到和复制到新的窗口中。“释放”和“锁定”是将当前节点固定住，不在和其他节点一起发生改变。在数据实验室中选择是指在原始数据中选择该节点对应的行。

7. 矩形选取，在一个矩形区域内选择一组节点。单击选项之后，通过鼠标来确定一个矩形区域。在确定区域之后，可以随机选择一个区域内部的节点，鼠标右键之后，可以进行类似于单点操作类似的对于区域内部的所有节点的操作。

8. 拖动工作是默认被选择的，右键可以将整个图形进行移动。左键指向某一个节点可以对某一个节点进行移动。最后可以通过鼠标的滚轮进行放大或者缩小当前的图形。

9. 单节点涂色选项：该选项是对当个节点进行涂色。单击次数的增加会让该节点的颜色加深。同时可以根据颜色选项来替换当前节点的颜色。
   

10. 大小调整选项： 当单独使用大小调整的时候，可以使用鼠标指向某个节点，拖拽之后扩大当个节点。同时也可以配合矩阵选取来使用。首先使用矩形选取来确定大小，在使用大小调整整个区域内部的节点大小。
    

11. 关联节点涂色：属于改变大小类似，关联节点涂色也可以为当个节点的关联节点进行涂色，也可以通过矩形选取来确定区域，给区域的关联节点进行涂色。在选择该选项之后，可以先确定颜色、颜色强度等等。同样多次点击可以增加颜色的强度。最后是选择扩散，可以是指关联范围的大小。包括，没有(只对当前节点涂色)，邻居(本身和一阶邻居涂色)，邻居的邻居(二阶邻居)，前者(指向该节点的节点)，后者(一阶邻居，不包括本身)。

12. 新建节点：在当前窗体内部新建一个节点，新建之前可以设置颜色和大小等等。

13. 新建边：在节点之间新建边，在新建之前可以设置边的类型是有向边还是无向边。同时还可以设置权重，默认为1.0。在使用的时候，需要先使用单个节点的选取来选择头尾节点。

14. 计算距离：同样通过和单个节点的选取选项配合来确定不同点之间的距离，并且以可视化的方式进行展示。

15. 节点范围：该选项的主要作用是给距离当前节点一定距离范围的节点进行涂色。

16. 节点属性：通过选择某一个节点，来查看该节点的尺寸，ID等一些属性信息。

1.4 下侧工具箱

首先，我们先给出下侧工具的作用图示：

1. 图形复位：主要作用是将放大，缩小，改变的图形变化成初始的形状。
2. 全部颜色复位：重新设置所有节点的颜色。默认为灰色。右键该标志可以设置默认颜色。
3. 复位标签颜色：将所有的标签颜色恢复到初始。
4. 复位标签大小：将所有的标签大小恢复到初始。
5. 背景颜色：重设背景颜色。
6. 截图：保存当前窗口内部的图形。保存中的抗锯齿表示的是保存图像的清晰度。
7. 节点标签显示开关：是否显示节点的标签，默认是关闭的。
8. 边显示开关：默认打开。
9. 边使用节点颜色的开关：边是否使用节点的颜色。
10. 边的粗细：拖拽之后可以控制边的粗细。
11. 标签大小：选择标签字体的大小。
12. 标签图色：选择标签字体的颜色。
13. 字体字号：编辑节点标签的字体，字号，字形。
14. 标签大小调节：在选定字号，拖拽来调整字体的大小。
15. 标签的缺省颜色：编辑缺省的标签的颜色。
16. 标签显示选择：定义图中显示节点和边的具体字段。
17. 工具的全局设置：
    
    这个位置用过包括3个选项项，相当于将上面的介绍的功能综合到这些选项中，更加的简洁的方式进行呈现。这里不再赘述了。

2 参考

1. 网络数据可视化与分析利器 Gephi中文教程