打开软件后，通过双击窗口灰色区域或点Prism(棱镜)的小三角，新建工程文件。在弹出的向导窗口选择表格类型为Grouped，如下图。

将数据复制粘贴到Prism的表格中，接下来需要对数据矩阵做转置，点击Analyze按钮，计算方法选Transpose X and Y，如下：

转置参数的设置保持默认即可，如下：

转置效果如下，当然也可在Excel中做完转置再粘贴到Prism中，这里主要还是想为大家介绍下Prism的分析功能。接着点击Graphs选项下新生成的图表，选择相应的图表类型。

堆叠图在Grouped 的summary data选项下，如下图。

接着对图表做一些个性化的调整，比如改变颜色、调整坐标轴的粗细等，这些操作在之前的教程已反复出现过，这里不做赘述。这里重点介绍一个非常好用的功能：反转堆叠顺序。

除了反转柱状图的堆叠次序之外，还可以反转相应的图例顺序，这样就可以方便地把“Unclassified”置于最“底”层，如下图。

第二种

首先，我们需要先对转置后的数据进行处理：计算每个物种的绝对丰度占比(即相对丰度)。点Analyze 按钮，计算方法选Fraction of total，如下：

计算方式选择按行计算，计算结果以百分数的方式显示(最大值为100)，设置如下：

然后打开计算结果页面，在Graph选项下新建图表，图表类型选择堆叠图，如下：

然后只需要对图表做些个性化的调整即可，比如，颜色可以选择只有两种色相的渐变色。图例的位置还可以自己调整，比如分成两列置于图表的下方等，这里不做赘述。

最终的效果如下：

最后，你也可以直接使用相对丰度绘制百分比堆叠图，这样就不需要用Prism计算百分数啦！如果你想学习Prism这个软件可以点击 阅读原文，观看刚上线的Graphpad Prism科研作图系列视频教程，好啦，今天的内容就到这里啦！

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